Las excelentes condiciones naturales del puerto posibilitan la existencia de una gran variedad de embarcaciones fluviales para el proceso de transferencia de cargas entre los buques y las orillas o entre las orillas.
El transporte fluvial es, actualmente y en especial en los países del centro de Europa, un medio de transporte muy importante, incluido en el sistema global e integrado de transporte y logística.
Consciente de esa realidad, y buscando nuevas y mejores formas de potenciar la actividad portuaria, la intención de APL es colaborar y apoyar el desarrollo de proyectos con el objetivo de dinamizar el tráfico fluvial de mercancías en el estuario del Tajo, aprovechando, para ello, las condiciones únicas de navegabilidad, así como las ventajas competitivas que puedan surgir, en cuestiones de economía global, en la cadena logística, además de los beneficios en cuestiones medioambientales y energéticas.
La apuesta en este tipo de tráfico provocará un incremento de la intermodalidad, inclusivamente a través de la instalación de nuevas plataformas logísticas en el área metropolitana de Lisboa, permitiendo que el aumento de la actividad portuaria en Lisboa no cause impactos sociales y medioambientales significativos en la ciudad.