A adopção do código ISPS nas instalações portuárias e o significativo reforço das medidas de segurança que visam a integridade do comércio marítimo e de toda a cadeia logística de transporte, têm obrigado a Autoridade Portuária à aplicação de procedimentos de segurança e de protecção das instalações.

Nesta perspectiva foi feito um considerável esforço no sentido de dotar as instalações portuárias directamente geridas pela APL, S.A., nomeadamente os Terminais de Passageiros de Alcântara, Rocha e Santa Apolónia, com equipamentos de apoio à gestão do controlo de acessos, nomeadamente torniquetes mecânicos, circuitos de vídeo-vigilância, integrados numa rede de leitores de cartões de proximidade.